genefirst ATOM-Seq技術(shù)概述

XCeloSeq文庫(kù)制備產(chǎn)品采用了獲得的GeneFirst突破性技術(shù)ATOM-Seq®。這種方法使用一種簡(jiǎn)單而優(yōu)雅的化學(xué)方法來(lái)捕獲DNA，原始分子充當(dāng)引物，其3'端通過(guò)聚合酶延伸。

使用ATOM-Seq方法，將分子標(biāo)識(shí)符（UMI）和通用銜接子序列直接并入每個(gè)原始樣品分子的可用3'端。

樣品DNA或cDNA與銜接子模板寡核苷酸結(jié)合

DNA分子退火至ATO的3'末端。

ATO反應(yīng)

?

動(dòng)手時(shí)間：  5分鐘 

孵育時(shí)間：70分鐘

退火后，聚合酶以ATO序列為模板延伸原始分子。

使用其ATO模板，聚合酶將分子標(biāo)識(shí)符（UMI）和通用引物位點(diǎn)整合到捕獲的分子中。

線性放大

?

動(dòng)手時(shí)間：5分鐘

 
孵育時(shí)間：35分鐘

通用引物用于多輪線性擴(kuò)增，從而改善了誤差校正。這也意味著即使線性產(chǎn)物在有義和反義鏈靶向富集之間進(jìn)行劃分，所有原始副本都可以在下游反應(yīng)中顯示

靶向cfDNA

協(xié)議時(shí)間：

總計(jì)：5h 40m

動(dòng)手：1h 20m

輸入金額：

推薦：5-50ng

?。?ng

靈敏度：

等位基因頻率： ≥0.1 ％

靶向RNA

協(xié)議時(shí)間：

總計(jì)：7h 20m

動(dòng)手：1h 55m

輸入金額：

推薦：5-200ng

?。?ng

既已知又

未知基因融合

檢測(cè)：

全基因組

協(xié)議時(shí)間：

總計(jì)：4h 45m

動(dòng)手：2h

輸入金額：

推薦：5-50ng

小：1ng

ATOM-Seq的主要優(yōu)勢(shì)